На Западно-Сибирской магистрали действует 14 ремонтных вагонных депо: Омск-Сортировочный, Московка, Купино, Барабинск, Инская, Болотное, Тайга, Кемерово, Топки, Ленинск-Кузнецкий, Белово, Новокузнецк-Сортировочный, Бийск, Рубцовск. Наибольшее количество вагонов отремонтировано в депо Московка – 3386 вагонов, Белово – 3143 вагона, Ленинск-Кузнецк – 3057 вагонов и Рубцовск – 2954 вагона.

За 12 месяцев 2005 года в вагонных депо ЗСЖД отремонтировано 33202 грузовых вагона парка ОАО "РЖД" при плане 33140 вагона, в том числе 30275 полувагонов, 292 крытых вагона, 268 универсальных платформ, 776 цистерн, 1529 прочего оборудования.

За 2005 год также было отремонтировано 6551 грузовых единиц, которые находятся в собственности промышленных предприятий. Доходы, полученные от предоставления услуг промышленным предприятиям за 12 месяцев 2005 года, составили 247 млн. рублей, сообщила служба по связям с общественностью ЗСЖД.