Самую значительную часть вложений – 4 миллиарда 533 миллиона рублей - ОАО "РЖД" инвестирует в комплексную реконструкцию участка Карымская - Забайкальск. В 2006 году здесь будет уложено 74,1 км вторых путей на пяти перегонах, 17,49 км приемо-отправочных путей на семи станциях, построено 12 мостов. При этом ежесуточная пропускная способность южного хода магистрали на участке Борзя - Забайкальск, примыкающего к российско-китайской границе, увеличится с 19 до 32 пар поездов в сутки. Это позволит нарастить объемы грузоперевозок между Россией и Китайской Народной Республикой.

На обновление искусственных сооружений, электроснабжения и другие проекты, направленные на увеличение скорости доставки грузов по забайкальскому участку Транссиба, компанией "Российские железные дороги" выделено 2 миллиарда 690 миллионов рублей. На приобретение нового подвижного состава - 2 миллиарда 240 миллионов рублей. На дальнейшее улучшение качества перевозок по транспортному коридору Кузбасс - Дальний Восток Забайкальской магистрали выделен 1 миллиард 268 миллионов рублей. Средства пойдут на реализацию программ "корпоративная информатизация", "обеспечение безопасности движения" и др.

Забайкальская железная дорога продолжит строительство жилья для работников компании. В течение 2006-2008 годов будет сдана вторая очередь 80-ти квартирного дома в Карымской, 30-ти квартирный дом в Оловянной, 60-ти квартирный дом в Борзе, 97-ми квартирный дом малосемейного типа в Забайкальске и несколько двухквартирных домов на линейных станциях участка Карымская - Забайкальск.

Магистраль – крупнейший в Читинской области налогоплательщик. В 2005 году Забайкальская железная дорога перечислила в консолидированный бюджет Читинской области 1 миллиард 748 миллионов рублей, сообщила служба по связям с общественностью ЗабЖД.