Необходимость профилактики вирусных инфекций продиктована опытом прошлых лет. Так, зимой 1999 года гриппом и острыми респираторными инфекциями переболел каждый третий работник ЮУЖД. В результате дорога понесла убытки в размере более 55 млн. рублей. В 2000 году отрицательную динамику удалось снизить: благодаря целенаправленной вакцинации количество заболевших гриппом уменьшилось на 13% по сравнению с 1999 годом. В первом полугодии 2001 года случаи заболевания гриппом сократились в 2 раза по сравнению с аналогичным периодом 2000 года. По распоряжению начальника ЮУЖД Юрия Дьяконова на 2001/2002 гг. была закуплена большая партия антивирусного препарата и противогриппозной вакцины. Заблаговременная профилактика гриппа и других вирусных инфекций значительно снижает уровень заболеваемости. В первую очередь вакцинацию прошли работники магистрали, непосредственно связанные с обеспечением движения поездов (машинисты, помощники машинистов и другие). По словам заместителя начальника врачебно-санитарной службы ЮУЖД Николая Рештаненко, в настоящее время уровень заболеваемости гриппом и ОРЗ на дороге на 30% меньше по сравнению с 1999-2000 гг, сообщил Центр общественных связей ЮУЖД.