В соответствии с заключенными соглашениями на 2009 год, бюджетами субъектов предусмотрено 541,7 млн рублей расходов на железнодорожный транспорт, в том числе на пригородный комплекс – 385,7 млн рублей. За 11 месяцев 2009 года пригородными пассажирскими компаниями ЗСЖД перевезено 58,3 млн пассажиров, заработано доходов на сумму 2 млрд 747,7 млн рублей.

В 2009 году от общего количества пассажиров, которые относятся к категории федеральных льготников, 35% сохранили за собой льготу на проезд в пригородном железнодорожном транспорте. Между пригородными компаниями и ОАО "РЖД" заключены договоры на выполнение социального заказа о возмещении потерь доходов от перевозки льготных категорий граждан федерального значения, обладающих социальным пакетом. Так, за январь-ноябрь 2009 года перевезено 10,6 млн пассажиров-федеральных льготников, предоставлено льгот на сумму 460,5 млн рублей, ОАО "РЖД" компенсировано полностью.

В 2009 году в Омской области и Алтайском крае льготы по проезду в пригородном железнодорожном транспорте для всех региональных льготников оставлены в натуральном виде. В Томской области заменены денежными выплатами (льгота в натуральном виде сохранена пенсионерам и многодетным семьям Томска в виде летних сезонных скидок). В Новосибирской и Кемеровской областях льготникам было предоставлено право выбора, и соответственно 48% и 78% льготников сохранили право на льготный проезд в пригородном железнодорожном транспорте на 2009 год. За 11 месяцев 2009 года перевезено 4,6 млн пассажиров-региональных льготников, предоставлено льгот на сумму 127 млн рублей, перечислено администрациями 86 млн рублей.

В бюджетах Омской, Кемеровской областей и Алтайского края на 2009 год предусмотрено 254,1 млн рублей средств на возмещение убытков от государственного регулирования тарифов. За январь-ноябрь 2009 года получено 142,4 млн рублей.

За 11 месяцев 2009 года от администрации Алтайского края получено 70 млн рублей на реконструкцию железнодорожного вокзала на станции Бийск, 20 млн рублей – на благоустройство территории в районе железнодорожного моста через реку Обь в городе Камень-на-Оби. От мэрии Новосибирска получено 25 млн рублей на строительство ледового спортивного комплекса "Локомотив" в Новосибирске. На ремонт автоподходов к железнодорожным переездам получено от администрации Омской области 2 млн рублей, от администрации Кемеровской области – 2 млн рублей. На ремонт пассажирских посадочных платформ получено от администрации Томской области 3 млн рублей, сообщила служба по связям с общественностью ЗСЖД.