На каждом из семи отделений дороги как структурные подразделения имеются железнодорожные станции, локомотивные и вагонные депо, дистанции пути, дистанции сигнализации и связи, дистанции гражданских сооружений, водоснабжения и водоотведения, погрузочно-разгрузочных работ.
В ведении МЖД - школы № 1, №2, №3, Калужская, Тульская,  Курская дорожные технические школы. В составе Московско-Рязанского отделения действует дорожная химико-техническая лаборатория. Смоленское отделение дороги содержит санаторий-профилакторий, а Брянское – два санатория-профилактория в городе Унеча и "Синезерки", сообщила пресс-служба МЖД.