Строительство станции было начато в 1902 году одновременно со строительством железной дороги Вятка-Вологда-Череповец-Петербург, и уже 1 июля 1905 года станция Череповец приняла первые поезда. Сначала их было совсем немного – только 4 поезда в сутки: 2 пассажирских и 2 грузовых. Но одновременное строительство станции Череповец-пристань послужило толчком к интенсивному развитию: Череповец стал крупным перевалочным пунктом с водного транспорта на железнодорожный.

Объем работы Череповецкого железнодорожного узла постоянно увеличивался, наращивая свои мощности за счет строительства Череповецкого металлургического, азотно-тукового, химического заводов. В связи с этим в 1955 году была сдана в эксплуатацию грузовая станция Череповец-2, а в 1986 – сортировочная станция Кошта с примыканием к ней подъездных путей металлургического комбината и химзавода.

Сейчас Череповецкий железнодорожный узел  - крупнейший не только на Вологодском отделении, но и на всей Северной железной дороге, на котором ежемесячно грузится около 18 тысяч вагонов. Коллектив станции – а это более 400 человек, работающих на станциях Череповец-1, Череповец-2 и Кошта - работает в напряженнейшем режиме - увеличился поток транзитных грузов с Урала, Дальнего Востока в порты Санкт-Петербурга, Мурманска, Архангельска. Через станцию за сутки проходит транзитом 120 грузовых, 20 пассажирских поездов, до 30 составов, прибывающих в ОАО "Северсталь" и на другие предприятия Череповца, сообщила служба по связям с общественностью СЖД.