Создание Алтайской железной дороги и станции Барнаул стало весьма значимой вехой в истории региона. 18 сентября 1915 года было завершено строительство железнодорожного моста через Обь, а 8 октября того же года из Ново-Николаевска (нынешний Новосибирск) в Барнаул прибыл первый поезд, доставивший 290 пудов почты.

Для Барнаула, как для всего Алтайского края, расположенного на юго-западной окраине Сибири, в стороне от Транссибирской магистрали, появление железной дороги означало в буквальном смысле новую жизнь. Благодаря ей, город получил возможности для быстрого развития. Особенно бурным оно было в годы Великой Отечественной войны.

Станция Барнаул приняла в это тяжелейшее для страны время огромное количество эшелонов с оборудованием заводов из европейской части страны. Возведенные на новом месте в кратчайшие сроки предприятия начинали работать для фронта. Завод "Трансмаш", например, выпускал двигатели для знаменитых танков Т-34, а нынешний станкостроительный (тогда он обозначался как "завод №17") стал основным поставщиком патронов для воюющей армиии. В далекий путь продукция для фронта отправлялась со станции Барнаул. Перестроившись после Победы на выпуск мирной продукции, эвакуированные предприятия превратили Барнаул из заштатного города с мелкими полукустарными производствами в крупный индустриальный центр.

Сегодняшнее большое хозяйство станции включает более ста централизованных стрелочных переводов, 19 путей, 8 маневровых районов с примыканием самого крупного за Уралом по протяженности предприятия промышленного железнодорожного транспорта - ОАО "Сибпромжелдортранс".

Коллектив демонстрирует устойчивую динамику роста показателей. Если в 2002 году на станции было отправлено 119 тысяч вагонов и погружено 15 тысяч, то в прошлом году, соответственно, 122 тысячи и 18 тысяч. А по итогам работы в 1-ом квартале 2005 года ст. Барнаул заняла 2-ое место в отраслевом соревновании.

Со станции Барнаул уже много лет, начиная с первого рейса в 1967 году, ежедневно отправляется в путь фирменный поезд "Алтай" сообщением Барнаул - Москва – один из лучших по комфорту для пассажиров на железных дорогах страны, а с августа 2003 года начал курсировать до Новосибирска и обратно скоростной электропоезд "Экспресс Алтая". Благодаря скорости, комфорту и доступным ценам на билет, он успешно конкурирует с автобусным сообщением до крупнейшего города Сибири, сообщила служба по связям с общественностью ЗСЖД.